A Szívkatéteres Műtő Intézetünk felnőtt ellátásért felelős épületében, az első emeleten helyezkedik el. Itt történnek mind a felnőtt, mind a gyermekkori hemodinamikai vizsgálatok, azaz szív- és érkatéterezések. Gyermekkorban akkor merül fel szívkatéterezés, amikor a kevésbé invazív vizsgálatokkal nem tudunk pontos diagnózist felállítani, vagy katéteres úton gyógyító beavatkozást tervezünk. Intézetünk szívkatéteres laborjában a gyermekkori beavatkozások altatásban, a műtői sterilitási szabályok betartásával történnek. A vizsgálatokat gyermekkardiológusok végzik, az altatásért és a gyermek légzési és keringési stabilitásáért a Gyermekszív Központ aneszteziológus orvosai felelősek. Amennyiben a beavatkozás során valamely szívhiba gyógyítására vagy javítására is törekszünk, akkor azt katéter intervenciós beavatkozásnak nevezzük.